根據不同的分類標準，酶標板有著不同的分類。
一、根據孔數，可分為96孔、48孔，其中96孔是現(xiàn)在zui常用的，因為酶標板就是配合酶標儀用，現(xiàn)在的酶標儀做出來的zui多的是96孔，所以客戶在購買時也是要96孔板，也為了適應市場基本上做出來的就是96孔的。
二、根據其底部的不同，又分為平底的，U型底、V型底。平底的折射率低，適于在酶標儀檢測；U型底的酶標板折射率較高，方便加樣、吸樣、混勻等操作，可以不用放在酶標儀上，直接通過目測觀察顏色變化情況，從而判定有無相應的免疫反應。V底的酶標板可以的吸取樣品。
三、根據酶標板與蛋白和其它分子結合能力的不同，又分為高結合力，中結合力和氨基化的。
1） 高結合力
此種酶標板，表面經處理后，其蛋白結合能力大大增強，可達300~400ng IgG/cm2，主要結合的蛋白分子量＞10kD。使用該類酶標板可提高敏感性，并可相對減少包被蛋白的濃度和用量，不足之處為較易產生非特異性反應。抗原或抗體包被后，以非離子去污劑無法有效地封閉未結合蛋白的部位，需使用蛋白作為封閉劑。
2） 中結合力
此類酶標板經表面疏水鍵被動與蛋白結合，適合作為分子量＞20kD的大分子蛋白的固相載體，其蛋白結合能力為200~300ng IgG/cm2。由于該類酶標板所具有的僅與大分子結合的特性，適用于作為未純化抗體或抗原的固相載體，可降低潛在的非特異性交叉反應。該類板可以惰性蛋白或非離子去污劑作為封閉液。
3）氨基化
這種酶標板經表面改性處理后擁有帶正電荷的氨基，其疏水鍵由親水鍵取代。該類酶標板適合作為小分子蛋白的固相載體。使用合適的緩沖液和pH值，其表面可通過離子鍵與帶負電荷的小分子結合。由于其表面的親水特性和可通過其它交聯(lián)劑共價結合的能力，可用于固定溶于Triton-100、Tween 20等去污劑的蛋白分子。該類板的缺陷為由于降低了疏水性，一部分蛋白分子無法結合；此外，其表面需有效地封閉。由于親水和共價的表面特性，使用的封閉液必須能夠與非反應性氨基基團和所選擇的交聯(lián)劑中任何功能基團發(fā)生作用。
四、另外根據顏色又分為透明、黑色、白色。
透明的是zui常用的，用于zui一般的酶聯(lián)免疫實驗。相對于透明的的板子，還有用于發(fā)光檢測用的不透明的板子，一般有黑色和白色兩種。黑色的酶標板自身會有光吸收，所以它的信號相對于白色的板子要低很多，因此一般用于檢測較強的光，如熒光檢測。而白色的酶標板就用于較弱的光檢測，常用于一般的化學發(fā)光。另外黑色的酶標板還可以消弱非特異反應帶來的問題。有些客戶會問，用一般的酶標板可不可以進行發(fā)光檢測，回答是不可以的，因為一般從化學發(fā)光反應中發(fā)射出的光是各向同性的，也就是說各個方向上同等發(fā)射出來的。如果用透明的板子，光不僅會從垂直方向發(fā)散，還從水平方向發(fā)散出來。很容易的就會通過各個孔之間的間隙和孔壁。這樣的話，光較強時相鄰孔之間的影響就會很大，因此不能用透明的酶標板來進行化學發(fā)光實驗。
五、現(xiàn)在大家看到的酶標板大多是可以拆卸的，也就是單條可以拆下來，也有固定的板子。單條可拆的的板子其實可以省下許多錢，因為這樣的話，當你想用新的酶標板時，可以將酶標板條拆下來，買些酶標板條就可以了，只是要考慮要配相同的型號即可。另外，可拆的酶標板可以用來做體外檢測，方便拆卸。
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